院徽整体设计与滨州医学院校徽整合统一，寓意博爱、平等、完美的人文情怀，象征正直、高尚、进取的医学精神。院徽整体宣示“智圆行方”，标明滨医附院人广博精深的医疗技术和方正不拘的医德风尚。院徽采用深蓝色为标准色，象征纯洁、严谨、温和、生命、希望和健康。

院徽中间主体图案包括以下多层含义：主体上部取自滨州医学院古老悠久的门坊造型，寓意医院传承学校人文理念，发扬医学人道精神，行仁心、施妙术、济苍生。主体下部为一副盾牌的变形，寓意呵护生命、消除病痛、守护健康。主体镂空处上方为“１９７７”字样，记载医院创建历史，展现医院发展历程；镂空处下方为单蛇缠杖标志，寓意医学的权威性和严肃性，激励滨医附院人为伟大医学事业而不懈追求。